Langs de MerwedeLingelijn worden niet alleen nieuwe stations gebouwd, ook bestaande stations krijgen een facelift. Die projecten hebben echter enige vertraging opgelopen ten opzichte van eerder gecommuniceerde data.
Zo is bij station Sliedrecht een stevige opknapbeurt van de stationsomgeving voorzien. De sloop van het oude ticketgebouw is weliswaar gerealiseerd, maar met de uitbreiding van de P&R-zone is nog niet begonnen. Dat komt omdat dit project zich direct langs het spoor uitstrekt en de benodigde ontheffing van de Spoorwegwet vertraging heeft opgelopen.
Hetzelfde probleem doet zich voor bij het opknappen van de omgeving rond Station Arkel. Ook hiervoor is de benodigde vergunning nog niet verleend. De samenwerkende partijen zijn in overleg om tot een goede oplossing te komen. De vertraging door ontbrekende ontheffingen doet zich overigens ook voor bij MLL-station Beesd.